本发明提供一种基于衰减全反射傅里叶变换红外光谱技术的糙米中黄曲霉毒素含量的快速检测方法,包括以下步骤:样品准备,收集不同黄曲霉侵染程度的糙米样品,将糙米样品粉碎得到样品粉末,并冷藏待测;光谱检测,采用傅里叶变换近红外光谱仪扫描样品的光谱信息,并取部分过筛样品,测定糙米样品粉末中黄曲霉毒素B、B2、G、G及其总量的水平;数据预处理,对样品粉末的原始光谱信息进行预处理,消除干扰;定量预测分析,基于偏最小二乘回归分析方法(PLSR),依据糙米样品中黄曲霉毒素B、B2、G、G及其总量的水平与其相应光谱吸收值的对应关系,建立糙米样品中黄曲霉毒素真实含量水平与预测水平的相关关系模型;快速测定,利用前述建立的模型,基于待测的糙米的光谱信息而输出其黄曲霉毒素B、B、G、G及其总量水平。